@MASTERSTHESIS{ 2021:1999884201,
 	title = {Fatores de transcrição bHLH em Vitis spp. : caracterização e modulação transcricional sob inoculação bacteriana},
 	year = {2021},
 	url = "http://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede2/handle/tede2/9464",
 	abstract = "A videira é uma espécie frutífera de grande importância para o agronegócio. É cultivada desde o semiárido, às regiões de clima temperado, podendo atingir mais de duas safras por ano, como por exemplo, no Submédio do Vale do São Francisco (SVSF) – Estados de Pernambuco e Bahia –. No entanto, a viticultura tem sofrido com problemas fitossanitários relacionados ao ataque da bactéria Xanthomonas citri, causadora do cancro bacteriano, que tem comprometido o rendimento de diversas cultivares, portanto é necessário que seja entendida esta relação planta/patógeno, os fatores de transcrição (FTs) são proteínas que regulam genes envolvidos em diversos processos biológicos, incluindo a resposta a estresses abióticos e bióticos. As proteínas basic helix-loop-helix (bHLH) é uma das maiores famílias de FTs, com atuação reconhecida na tolerância/resistência a estresse abióticos e bióticos. Até o nosso conhecimento, não existem relatos sobre a atuação dessas proteínas na interação entre a videira e a bactéria X. citri. Dessa forma, o presente trabalho se propôs a avaliar o papel de FTs do tipo bHLH relacionados ao processo de defesa de Vitis spp. inoculadas com X. citri analisando sua expressão, diversidade e função no contexto em questão. Bibliotecas de RNA-Seq (Illumina HiSeq2500) foram geradas a partir de ensaio experimental utilizando clones de duas cultivares (Red Globe e IAC-572) inoculadas com X. citri. De posse do transcriptoma, foram realizadas as análises in silico através de ferramentas de bioinformática, inicialmente, foram mineradas sequências candidatas no genoma de Vitis vinifera disponível no Phytozome, onde foram identificadas 102 sequências, com seu domínio íntegro analisado no batch CD-search, os motivos conservados foram analisados no MEME, e estes foram correspondentes à região básica e a hélice-alça-hélice que constituem o domínio característico de FTs bHLH. A árvore fenética gerada por meio do MEGA7 juntamente com espécies de V. davidii formou 25 subgrupos. A análise de ontologia gênica foi enriquecida por meio do GO consortium e foi possível verificar que o processo biológico mais enriquecido corresponde à detecção de bactéria e atividade de proteínas quinases. O perfil de expressão in silico observado por meio de heatmaps gerados via software CLUSTER 3.0, e visualizados pelo TreeView, identificou 34 genes diferencialmente expressos (Log FC>0.50 e <-0.50), com a maior parte dos transcritos sendo induzida no híbrido IAC-572. A identificação desses genes é de grande importância para uso em estudos posteriores que envolvam eventos de transformação ou edição genética em videira, os quais poderão contribuir para o lançamento de cultivares resistentes ao cancro bacteriano.",
 	publisher = {Universidade Federal Rural de Pernambuco},
 	scholl = {Programa de Pós-Graduação em Melhoramento Genético de Plantas},
 	note = {Departamento de Agronomia}
}